Het onderhoud van provinciale vaarwegen bevat het onderhoud aan het Merwedekanaal, de Eem, de Linge, de Oude Rijn West, De Kromme Mijdrecht en de Grecht.
De in 2024 geplande dagelijks beheer- en onderhoudswerkzaamheden aan de vaarwegen zijn zoveel mogelijk volgens de gemaakte afspraken uitgevoerd.
Ook is in 2024 een nieuwe bestuurlijke afspraak met het Waterschap Vallei&Veluwe gemaakt en vastgesteld. Daarin wordt weergegeven wat het gezamenlijke doel wat betreft de Eem is en wat de nieuwe financiële bijdrage van het waterschap gaat worden. Met de gemeente Amersfoort is de provincie hierover (nog) in overleg.
Het nautisch beheer, het vaarwegbeheer en het onderhoud van het Utrechtse deel van het Merwedekanaal is ook voor het jaar 2024 integraal overgedragen aan de provincie Zuid-Holland. Er is daartoe in 2020 met de provincie Zuid-Holland een samenwerkingsovereenkomst afgesloten met een looptijd van vijf jaar. In 2024 is gestart met een evaluatie van deze samenwerkingsovereenkomst. Het doel is om eind 2025 een nieuwe samenwerkingsovereenkomst tussen de beide provincies bestuurlijk vast te stellen.
De Linge is over een lengte van circa 10 km aan de noordzijde in eigendom van de provincie; Waterschap Rivierenland heeft het beheer en onderhoud gemandateerd uitgevoerd.
In opdracht van de Provincie Utrecht zijn de overige waterwegen, Kromme Mijdrecht en Grecht, beheerd en onderhouden door de onderscheidende waterschappen/Hoogheemraadschappen.
De Eem, de vaargeul in de Eemmond en de Oude Rijn West worden door de provincie Utrecht zelf onderhouden.
